Tytuł ten pozwala nam wcielić się w jednego z czterech bohaterów: Snake’a, Meryl, Otacona lub Gray Foxa. Wykorzystać zatem należy ich mocne strony, aby hakować terminale, infiltrować wrogie bazy i po cichu neutralizować strażników. Gra przepełniona jest taktyczną akcją i szpiegowskim klimatem. Przeprowadzamy zatem wspólną infiltrację bazy Shadow Moses w ramach rozbudowanej kampanii składającej się z 14 misji fabularnych. Do dyspozycji mamy innowacyjny system ukrywania w misjach skradankowych, walkę z kultowymi bossami serii (Psycho Mantis i inni!).

Twórcy wprowadzili tutaj intuicyjny system Pola Widzenia, który pozwala nam na emocjonującą infiltrację, a mechanika żetonów uwagi umożliwia ucieczkę przed wzrokiem strażników i powrót do ukrycia nawet po wykryciu. Podczas rozgrywki należy zatem planować ruchy tak, by unikać patroli i kamer monitoringu, korzystając z intuicyjnego systemu. Kiedy jednak narobimy hałasu lub wejdziemy w PW wroga, ściągniemy na siebie uwagę, ale dzięki mechanice resetowania alarmu wciąż mamy szansę uciec i wrócić do cienia. Przy tym wszystkim w grze będziemy mogli gromadzić kultowe wyposażenie, od racji żywnościowych po wyrzutnie rakiet Nikita i gogle termowizyjne.